Gif génial. Je dirais pas que je suis "expert", mais j'ai fait beaucoup de dynamique moléculaire et c'est basiquement ça, utiliser la seconde loi de newton (celle qui a été conçu pour prédire le mouvement des corps célestes) pour calculer l'évolution d'un système à l'échelle atomique. Tu parle d'une approximation haha, mais la beauté c'est que ça marche relativement bien pour prédire certaines propriétés du système et mieux les comprendre. Là la quantité d'atome qui est montrée est tout simplement trop importante pour faire de la dynamique moléculaire avec une précision atomique. C'est surement une simplification, de la dynamique "coarse grain", ou alors une vue artistique. Avec la dynamique moléculaire tout atome, on peut voir par exemple un médicament comme le LSD entrer dans son site actif, et activer le récepteur. C'est un peu comme un microscope atomique.
Pour répondre à ta question, je connais très mal les modes de transports de vésicules à l'intérieur d'une cellule. Mais les opiacés ils activent tout bêtement les récepteurs MOR à la place des endorphines. Ca ne doit pas, en tout cas pas à ma connaissance, jouer sur la vitesse de la myosine à se déplacer et à libérer des endorphines. Après je sais que l'alcool joue directement sur la libération d'endorphines, est-ce que c'est parce qu'il arrive à traverser les membranes des neurones et pénétrer l'intérieur pour se lier et activer des cibles ? Surement mais je ne connais pas lequels !
